Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMED5Q9Y3A6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMED5Q9Y3A6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMED5Q9Y3A6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMED5Q9Y3A6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms