Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms