Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FARSAQ9Y285 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms