Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms