Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms