Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms