Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms