Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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