Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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