Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms