Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms