Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CWC25Q9NXE8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms