Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms