Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms