Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms