Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC22A11Q9NSA0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC22A11Q9NSA0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC22A11Q9NSA0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC22A11Q9NSA0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC22A11Q9NSA0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC22A11Q9NSA0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC22A11Q9NSA0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms