Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms