Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms