Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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