Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms