Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms