Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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FOXQ1Q9C009 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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FOXQ1Q9C009 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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FOXQ1Q9C009 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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