Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms