Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD3Q9BZ95 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms