Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV8

CEP41, Centrosomal protein of 41 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP41Q9BYV8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP41Q9BYV8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP41Q9BYV8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms