Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms