Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms