Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms