Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms