Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIOK2Q9BVS4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms