Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms