Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms