Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00467Q9BRT7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms