Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms