Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGREF1Q99674 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms