Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPS8Q99627 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms