Protein–RNA interactions for Protein: Q99527

GPER1, G-protein coupled estrogen receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPER1Q99527 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPER1Q99527 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms