Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms