Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms