Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms