Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGAP1Q96PV0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms