Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms