Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
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