Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms