Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms