Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPNQ96H22 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms