Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUB2Q96DC9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms