Protein–RNA interactions for Protein: Q96A23

CPNE4, Copine-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4Q96A23 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE4Q96A23 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE4Q96A23 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE4Q96A23 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE4Q96A23 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE4Q96A23 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE4Q96A23 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE4Q96A23 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE4Q96A23 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE4Q96A23 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE4Q96A23 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE4Q96A23 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms