Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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GTF3C6Q969F1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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GTF3C6Q969F1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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GTF3C6Q969F1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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GTF3C6Q969F1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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GTF3C6Q969F1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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GTF3C6Q969F1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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GTF3C6Q969F1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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GTF3C6Q969F1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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GTF3C6Q969F1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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