Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms